Sähköinen taloushallinto on tullut jäädäkseen, eikä kehitys ole pysähtymässä. Uudet ohjelmistot eivät kuitenkaan viesti itsestään keskenään, jolloin tarvitaan integraatioita.
Lappeenrannan teknillisen yliopiston yhdessä Itä-Suomen yliopiston kanssa tekemän tutkimuksen mukaan tilitoimistot ovat jakautuneet erilaisiin ryhmiin sähköisen taloushallinnon soveltamisen suhteen.
EU:n tietosuoja-asetuksen myötä yrityksen henkilötietoja sisältävien tiedostojen käsittely, kansioiden käyttöoikeuksien hallinta ja käyttöhistoriatietojen saatavuus korostuvat.
